מרכז קומפר מעורב בארגון כנסים, סמינרים, וסדנאות. צוות המרכז מציג ידע אקדמי שנצבר במסגרת פעילותו, לפקידי ממשלה, מחנכים, חוקרים, גורמים ציבוריים, קהילות מקומיות ולרבים אחרים. זאת, במטרה להעלות את המודעות הציבורית לתופעות האנטישמיות החדשה והדה-לגיטימציה נגד ישראל ולקדם את הלחימה בהן.
הניסיון המצטבר של המרכז מראה כי כנסים וסדנאות חוקרים מקדמים ביעילות את המטרות הללו. כוונתנו היא להמשיך לקיים אירועים אלה בפורמטים שונים, תוך שיתוף פעולה עם גורמים חיצוניים.
